| メーカー希望小売価格 | 中古バイク相場 | 14万8000円〜63万9000円 | |
| 新車相場 | ランキング | 4位 （ネイキッド＆ストリート(126cc以上)） |
|
| ユーザー評価 | 4.6点 （51人が投稿） | クチコミ | 5655件 |
1993年に登場したXJR400から連綿と続くヤマハのミドルネイキッド。オーリンズリヤサスペンション装備のＳを経て、1995年にはエンジン性能に磨きをかけ、オーリンズとブレンボのフロントブレーキキャリパーを装備したXJR400Rが誕生。1998年にタンク容量を20LにしたＲに一本化、2001年にマイナーチェンジを敢行し、性能とクオリティが向上した。ゼッケン風カウル付きのRIIもラインナップされた。
| 全長（mm） | 2025 | サスペンション形式（前） | テレスコピック式 |
| 全幅(mm) | 745 | サスペンション形式（後） | スイングアーム式 |
| 全高（mm） | 1080 | ブレーキ形式（前） | 油圧ダブルディスク |
| シート高（mm） | 770 | ブレーキ形式（後） | 油圧シングルディスク |
| 乾燥重量（kg） | 175 |
| エンジン種類 | 空冷4ストロークDOHC 4バルブ並列4気筒 | クラッチ形式 | 湿式多板コイルスプリング |
| 総排気量 | 399cc | 変速機形式 | 常時噛合式6段リターン |
| 最高出力(kW/rpm) | 53PS/11000 | 燃料供給方式 | キャブレター式 |
| 最大トルク(N・m/rpm) | 3.5kgf･m/9500 | 潤滑方式 | 強制圧送ウェットサンプ |
| 始動方式 | セルフ式 | 燃料タンク容量（L) | 18 |
